1、细菌飘尘被过滤膜截留下不能杀灭，在适宜温湿度下极易自身繁殖，造成污染发霉等现象，继续使用极易发生二次污染。

2、由于大气污染严重，过滤膜极易被阻塞，需频繁更换，使用成本高且较繁杂。

3、依托高效过滤膜虽然解决了洁净度问题，但洁净室内的有毒有害气体异味以及净化系统自身产生的化学污染无法得到解决。